임균에 감염이 된 여성의 80%는 아무런 증상이 없다.

여성의 경우 균에 감염이 되어 있다고 하더라도 아무런 증상도 없는 경우가 많으며 증상이 있는 경우라도 아주 미미해서 병이 심해지기 전에는 모르는 경우가 많다. 대표적인 증상으로는 배뇨시 화끈거림(burning sensation)이나 질분비물(냉대하)의 증가이다.

질분비물이 황녹색을 띄면 임균의 가능성이 더 높다. 또한 비정상적인 질출혈로 인해 생리기간 사이에 출혈이 있기도 한다.

만약 감염이 더 진행되어 자궁이나 난관에까지 진행되면 하복부통증, 열이나고, 성관계중 통증이 심해지기도 하는데 이런 경우를 의학적으로는 골반염(PID; pelvic inflammatory disease)이라고 한다. 골반염은 장기간의 치료가 필요하고 나중에 자궁외 임신이나 불임등의 합병증을 초래할 수 있어 위험한다.

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