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EGPUs의 주요 병목 현상 중 하나는 Thunderbolt3의 한계와 관련이 있다는 점에 유의해야 함. TB3는 4개의 PCIe레인 이상으로만 전송¹⁾할 수 있는 반면, 그래픽 카드는 보통 16개의 레인을 사용함. 각 레인이 PCI버스가 사용할 수 있는 대역 폭의 일부와 동일하기 때문에 TB3이상의 그래픽 카드를 사용하면 GPU의 모든 전력을 사용할 수 없다.