유일한 생존자 (Sole survivor)는 갑작스런 기습으로 레일로드를 공격한 브라더후드 오브 스틸에게 프리드웬에 몰래 잠입하여 폭탄을 설치하고 프리드웬을 폭파시켜 버렸다. 동시에 글로리의 복수도 해주었다. 하지만 아직 인스티튜트 (Institute)는 커먼웰스 (The Commonwealth)에 남아있다. 레일로드의 위치가 발각된 이상 인스티튜트에게도 무사할 수 없다. 유일한 생존자는 인스티튜트로 돌아가 인스티튜트를 끝장내야 함. 그리고 커먼웰스에 평화를 가져와야 함.

타 루트와는 달리 레일로드 루트에선 끝까지 인스티튜트와 우호적임으로 인스 티튜트로 빠른 이동을 여전히 할 수 있다. 

이제 인스티튜트로 순간이동을 한 뒤 중앙 광장의 엘리베이터를 타고 올라가 처음 인스티튜트로 들어왔을 때 그 순간이동기로 향하면 된다. 거기에선 Z1이 있다. Z1은 순간이동기로 레일로드 요원들을 부를테니 우선 여기에 있는 인스티튜트 관계자들을 모두 죽이라고 함. 모두 다 처리하고 나면 Z1이 순간이동기를 조작하여 데스데모나 (Desdemona)와 레일로드 요원들을 소환함.

아래로 내려가 다 쳐죽이고, 파더 (Father)를 만난 뒤 핵융합로에 폭탄을 설치하고 밖으로 빠져 나오면 된다.

부실문서